В дополнительных опциях необходимо указать GPIO, к которому будет подключена кнопка для включения Safe Mode, а так же если требуется  активация режима при 0 логическом уровне, то требуется установить соответствующую галку.

Так же в дополнительных настройках можно отключить штатный режим перевода в Safe Mode используя RX-TX (GPIO 1 и 3) у ESP8266 и GPIO 18 и 19 у ESP32. Такая возможность может быть полезна, если железо, подключенное к данным GPIO переключает в режим Safe Mode из-за особенностей схемы.